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Alternative Splicing Gallery

Detail view for swissprot protein STX1A_HUMAN and isoform Q16623-3

Template: 1dn1
Sequence Identity (Template - Swissprot): 1.0
Coverage of swissprot protein: 0.7708333

Alignment

STX1A_HUMAN	MKDRTQELRTAKDSDDDDDVAVTVDRDRFMDEFFEQVEEIRGFIDKIAENVEEVKRKHSAILASPNPDEKTKEELEELMSDIKKTANKVRSKLKSIEQSI
1dn1		--------------------------DRFMDEFFEQVEEIRGFIDKIAENVEEVKRKHSAILASPNPDEKTKEELEELMSDIKKTANKVRSKLKSIEQSI
SSE		--------------------------CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VARSPLIC	                                                                                                    

STX1A_HUMAN	EQEEGLNRSSADLRIRKTQHSTLSRKFVEVMSEYNATQSDYRERCKGRIQRQLEITGRTTTSEELEDMLESGNPAIFASGIIMDSSISKQALSEIETRHS
1dn1		EQEEGLNRSSADLRIRKTQHSTLSRKFVEVMSEYNATQSDYRERCKGRIQRQLEITGRTTTSEELEDMLESGNPAIFASGIIMDSSISKQALSEIETRHS
SSE		HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
VARSPLIC	                                                                                                    

STX1A_HUMAN	EIIKLENSIRELHDMFMDMAMLVESQGEMIDRIEYNVEHAVDYVERAVSDTKKAVKYQSKARRKKIMIIICCVILGIVIASTVGGIFA
1dn1		EIIKLENSIRELHDMFMDMAMLVESQGEMIDRIEYNVEHAVDYVERAV----------------------------------------
SSE		HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCHHHHHHCCCCCCCCCC----------------------------------------
VARSPLIC	                          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS

Varsplic events:
VSP_006339 REPLACE 227-288 GEMIDRIEYNVEHAVDYVERAVSDTKKAVKYQSKARRKKIMIIICCVILGIVIASTVGGIFA => TMWRGPCLTPRRPSSTRARRAGRKS, affected aminoacids in template: 200-221 Color: Pink

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