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Alternative Splicing Gallery

Detail view for swissprot protein GCDH_HUMAN and isoform Q92947-2

Template: 1sir
Sequence Identity (Template - Swissprot): 1.0
Coverage of swissprot protein: 0.89041096

Alignment

GCDH_HUMAN	MALRGVSVRLLSRGPGLHVLRTWVSSAAQTEKGGRTQSQLAKSSRPEFDWQDPLVLEEQLTTDEILIRDTFRTYCQERLMPRILLANRNEVFHREIISEM
1sir		----------------------------------------------EFDWQDPLVLEEQLTTDEILIRDTFRTYCQERLMPRILLANRNEVFHREIISEM
SSE		----------------------------------------------CCCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
VARSPLIC	                                                                                                    

GCDH_HUMAN	GELGVLGPTIKGYGCAGVSSVAYGLLARELERVDSGYRSAMSVQSSLVMHPIYAYGSEEQRQKYLPQLAKGELLGCFGLTEPNSGSDPSSMETRAHYNSS
1sir		GELGVLGPTIKGYGCAGVSSVAYGLLARELERVDSGYRSAMSVQSSLVMHPIYAYGSEEQRQKYLPQLAKGELLGCFGLTEPNSGSDPSSMETRAHYNSS
SSE		HHHCCCCCCCEECCEECCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCECCECCCHHHCCCEEEEECC
VARSPLIC	                                                                                                    

GCDH_HUMAN	NKSYTLNGTKTWITNSPMADLFVVWARCEDGCIRGFLLEKGMRGLSAPRIQGKFSLRASATGMIIMDGVEVPEENVLPGASSLGGPFGCLNNARYGIAWG
1sir		NKSYTLNGTKTWITNSPMADLFVVWARCEDGCIRGFLLEKGMRGLSAPRIQGKFSLRASATGMIIMDGVEVPEENVLPGASSLGGPFGCLNNARYGIAWG
SSE		CCEEEEEEEEEEEECHHHCCEEEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCEECCECCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VARSPLIC	                                                                                                    

GCDH_HUMAN	VLGASEFCLHTARQYALDRMQFGVPLARNQLIQKKLADMLTEITLGLHACLQLGRLKDQDKAAPEMVSLLKRNNCGKALDIARQARDMLGGNGISDEYHV
1sir		VLGASEFCLHTARQYALDRMQFGVPLARNQLIQKKLADMLTEITLGLHACLQLGRLKDQDKAAPEMVSLLKRNNCGKALDIARQARDMLGGNGISDEYHV
SSE		HHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECCEEHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCHHHCH
VARSPLIC	                                                                                                    

GCDH_HUMAN	IRHAMNLEAVNTYEGTHDIHALILGRAITGIQAFTASK
1sir		IRHAMNLEAVNTYEGTHDIHALILGRAITGIQAFTA--
SSE		HHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC--
VARSPLIC	              SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS

Varsplic events:
VSP_000145 REPLACE 415-438 GTHDIHALILGRAITGIQAFTASK => VVQMCSLKRRWNSL, affected aminoacids in template: 368-389 Color: Pink

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