Propädeutikum Programmierung in der Bioinformatik (SS2016)

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Aktuelle Hinweise

Die Verantstaltung beginnt am 21.04.16.

Die Veranstaltung wird in Zusammenarbeit mit der Fachschaft Bioinformatik durchgeführt. Anhand von praktischen Beispielen werden grundlegende Konzepte der JAVA-Programmierung vertieft und erweitert. Der Schwerpunkt liegt auf Problemlösung und Projektplanung kleinerer Softwareprojekte: zu jedem Übungsprojekt gibt es zwar eine Aufgabenstellung, aber keinen vorgegebenen Lösungsweg. Die Projekte werden vor Ort in Einzel- oder Teamarbeit unter der Betreuung studentischer Tutoren bearbeitet. Da die Projekte nicht aufeinander aufbauen ist es möglich jederzeit einzusteigen.

Es erfolgt keine Semestralprüfung. Der Kurs wird zur Vorbereitung auf das Programmierpraktikum Bioinformatik empfohlen. Eine Anmeldung ist nicht erforderlich.

Zeit und Ort:

12ct-14

CIP Pool

Amalienstraße 17

Betreuer

Evi Berchtold
Samuel Klein
Klaudia Adamowicz

Voraussetzungen

Grundlegende Programmierkenntnisse aus den Veranstaltungen des 1. Fachsemesters.

Zeitplan und Projekte

Datum	Projekt	Folien	Material
21. April	Einführung; Snake	Einfuehrung.pdf	Snake.java
28. April
05. Mai	keine Veranstaltung (Christi Himmelfahrt)
12. Mai
19. Mai	Rosalind Challenge - Perl	perl.pdf	datasets.zip, loesungen.zip
26. Mai	keine Veranstaltung (Fronleichnam)
02. Juni		haufige_fehler.pdf
09. Juni
16. Juni	Breakout	breakout.pdf, tetris.pdf	fxgl-0.1.3.jar, assets.textures.zip
23. Juni
30. Juni
07. Juli
14. Juli	Vermutlich keine Veranstaltung (wegen Klausuren)

Projekt 1 - Snake

Programmierung des spieleklassikers Snake. Der Spieler kann über die Tastatur die Spielfigur steuern. Das Spielfeld wird auf einer grafischen Benutzeroberfläche ausgeben. Der Computer erhöht stetig die Schwierigkeitsstufe und überprüft, ob der Spieler noch 'lebt'.

Projekt 2 - Rosalind Challenge

Rosalind ist eine Platform auf der bioinformatische Probleme lösen kann. Man bekommt die Problemstellung mit einem Beispielinput, programmiert die Lösung und gibt den Output ab, der automatisch überprüft wird, so dass man sofort weiß ob die Lösung richtig war. Für die Challenge gibt es eine Rosalind Klasse (http://rosalind.info/classes/enroll/ee43c2ed33/) in der eine Auswahl von Problemen aus Rosalind verfügbar ist. Wer am Ende des Projekts die meisten dieser Probleme richtig gelöst hat bekommt einen Preis!

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