Propädeutikum Programmierung in der Bioinformatik (SS2015)

Projekt 1 - Snake

Programmierung des spieleklassikers Snake. Der Spieler kann über die Tastatur die Spielfigur steuern. Das Spielfeld wird auf einer grafischen Benutzeroberfläche ausgeben. Der Computer erhöht stetig die Schwierigkeitsstufe und überprüft, ob der Spieler noch 'lebt'.

Projekt 2 - Netzwerksimulation

Zunächst wird die nötige Datenstruktur zur Repräsentation eines Netzwerks implementiert. In diesem Fall handelt es sich um ein genregulatorisches Netzwerk: die Knoten stellen Gene dar, die Kanten regulatorische Beziehungen (Aktivierung oder Inhibition) zwischen diesen. Im zweiten Schritt wird der zeitliche Verlauf der Expression aller Gene im Netzwerk simuliert.

Projekt 3 - Genome Viewer

In diesem Projekt wird die Genstruktur eines Genoms per HTML visualisiert. Dazu wird zunächst eine Datei mit der Annotation gelesen und in eine passende Datenstruktur geladen. Die Datenstruktur wird anschließend in mehrere verlinkte html-Seiten ausgegeben und kann im Browser betrachtet und navigiert werden.