Proseminar Bioinformatik: Algorithmische Bioinformatik (WS 2015/16)

Aktuelle Hinweise

Die Vortragstermine und Vorbesprechungstermine stehen jetzt fest, teilweise werden letztere mehrere vor dem Vortragstermin stattfinden.

Allgemeine Informationen

Dozent:

Volker Heun
Benjamin Albrecht

Zeit und Ort:

12-14

Amalienstr. 17, A107

Termine

Mit Vorbesprechung ist in der folgenden Terminliste der letztmögliche Termin für die Vorbesprechung gemeint. Wer sich bis dahin nicht mit seinem Betreuer in Verbindung gesetzt hat, kann keinen Vortrag mehr halten.

20.07.15	Volker Heun Kickoff Folien (Download freischalten)
12.10.15	Volker Heun Einführungsveranstaltung Folien (Download freischalten)
09.11.15	Raphael Hagl Thema (4): Textcompression: Burrows-Wheeler-Transformation Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 26.10., 11:00
16.11.15	Jan Nasemann Thema (5): Suffix Arrays and BWT Betreuer: Benjamin Albrecht Vorbesprechung: 02.11., nach dem Proseminar
23.11.15	Christoph Bergmaier Thema (6): Algorithmic Concepts for Sequence Alignment Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 09.11., nach dem Proseminar
30.11.15 12st	Daniel Strobl Thema (7): Sequence Assembly Betreuer: Benjamin Albrecht Vorbesprechung: 16.11., nach dem Proseminar Kurzausarbeitung (Download freischalten)
30.11.15 13st	Alexander Harhoff Thema (3): Suffix Trees: Simple Algorithm and Applications Betreuer: Benjamin Albrecht Vorbesprechung: 19.10., nach dem Proseminar
07.12.15	Robin Becker Thema (8): Genome Rearrangements Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 23.11., 11:00
14.12.15	Luca Deininger Thema (9): Evolutionary Trees (Character-Based Methods) Betreuer: Benjamin Albrecht Vorbesprechung: 30.11., nach dem Proseminar Kurzausarbeitung (Download freischalten)
21.12.15	Stefan Loipfinger Thema (10): Evolutionary Trees (Distance-Based Methods) Betreuer: Benjamin Albrecht Vorbesprechung: 07.12., nach dem Proseminar Kurzausarbeitung (Download freischalten)
12/15&01/16	Weihnachten/Neujahr/Heilige Drei Könige
11.01.16	Diana Hagl Thema (1): String Matching: Knuth-Morris-Pratt and Boyer-Moore Betreuer: Volker Heun. Vorbesprechung: 30.11., 11:00
18.01.16	Georgios Tsitsiridis Thema (11): RNA Structure Prediction Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 14.12., nach dem Proseminar Kurzausarbeitung (Download freischalten)
25.01.16	Abschlussbesprechung

Literatur

Detaillierte Themenliste mit Literaturangaben

Hinweise

Allgemeine Hinweise des Veranstaltungsleiters zu Seminaren. Es wird dringend empfohlen diese zu lesen und zu beachten.
Ian Parberry's Speaker's Guide (Hinweise zum Halten von wissenschaftlichen Vorträgen, insbesondere in der theoretischen Informatik).
Es empfielt sich die Ausarbeitung in LaTeX zu setzen, da dies eigentlich das einzige bekannte Satzsystem ist, mit dem man auch größere Texte und insbesondere mathematische Formeln bequem handhaben kann. Hierfür gibt es ein Beispiel und die dazugehörige LaTeX-Datei, die weitere Informationen enthält (Die folgende PostScript-Datei wird zur Demonstration ebenfalls benötigt).

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