Proseminar Algorithmen der Bioinformatik (SS 2008)

Aktuelle Hinweise

Ab 19. Mai findet das Seminar im Seminarraum A105 in der Amalienstr. 17 statt.

Allgemeine Informationen

Leitung:

Simon W. Ginzinger

Volker Heun

Zeit und Ort:

12-14

Amalienstr. 17, SR 105

Termine

Mit Vorbesprechung ist in der folgenden Terminliste der letztmögliche Termin für die Vorbesprechung gemeint. Wer sich bis dahin nicht mit seinem Betreuer in Verbindung gesetzt hat, kann keinen Vortrag mehr halten.

14.04.	Volker Heun Einführungsveranstaltung Folien (Download freischalten)
21.04.	Rebecca Kaßner Thema (1): String Matching: Knuth-Morris-Pratt and Boyer-Moore Betreuer: Simon Ginzinger Vorbesprechung: 07.04.
28.04.	Andreas Kolberg Thema (2): String Matching: Shift-And and Karp-Rabin Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 14.04 Ausarbeitung (Download freischalten)
05.05.	Martin Lechner Thema (3): Suffix Trees: Simple Algorithm and Applications Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 21.04. Ausarbeitung (Download freischalten)
12.05	Pfingsten
19.05.	Max Liebkies Thema (4): Textcompression: Burrow-Wheeler-Transformation Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 28.04. Ausarbeitung (Download freischalten)
26.05.	Maximilian Munz Thema (5): Pairwise Sequence Alignment Betreuer: Simon Ginzinger Vorbesprechung: 05.05.
02.06.	Rupert Hofmarksrichter Thema (6): Biological Databases: Searching Betreuer: Simon Ginzinger Vorbesprechung: 19.05.
09.06.	Lucia Puchbauer Thema (7): Structural Alignment Betreuer: Simon Ginzinger Vorbesprechung: 26.05. Ausarbeitung (Download freischalten)
16.06.	Sabine Brunner Thema (8): Partial Digest Problem Betreuer: Simon Ginzinger Vorbesprechung: 02.06.
23.06.	Veit Höhn Thema (9): Sequence Assembly Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 09.06.
30.06.	Manuel Kanditt Thema (10): Genome Rearrangements Betreuer: Simon Ginzinger Vorbesprechung: 16.06.
07.07.	Cedric Landerer Thema (11): Evolutionary Trees Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 23.06.
14.07.	Abschlussbesprechung

Literatur

Detaillierte Themenliste mit Literaturangaben

Hinweise

Allgemeine Hinweise zu Seminaren
Es wird dringend empfohlen diese zu lesen und zu beachten.
Ian Parberry's Speaker's Guide (Hinweise zum Halten von wissenschaftlichen Vorträgen, insbesondere in der theoretischen Informatik)
Es empfielt sich die Ausarbeitung in LaTeX zu setzen, da dies eigentlich das einzige bekannte Satzsystem ist, mit dem man auch größere Texte und insbesondere mathematische Formeln bequem handhaben kann. Hierfür gibt es ein Beispiel und die dazugehörige LaTeX-Datei, die weitere Informationen enthält (Die folgende PostScript-Datei wird zur Demonstration ebenfalls benötigt). Ein Online-Kochbuch zu LaTeX ist ebenfalls verfügbar.

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