Proseminar Bioinformatik: Algorithmische Bioinformatik (SS 2016)

Aktuelle Hinweise

Die Vortragstermine und Vorbesprechungstermine stehen jetzt fest. Teilweise werden letztere 3 Wochen vor dem Vortragstermin stattfinden.

Allgemeine Informationen

Dozent:

Volker Heun

Zeit und Ort:

12-14

Amalienstr. 17, A107

Termine

Mit Vorbesprechung ist in der folgenden Terminliste der letztmögliche Termin für die Vorbesprechung gemeint. Wer sich bis dahin nicht mit seinem Betreuer in Verbindung gesetzt hat, kann keinen Vortrag mehr halten.

10.02.16	Volker Heun Kickoff
11.04.16	Volker Heun Einführungsveranstaltung
25.04.16	Nils Mehrtens Thema (1): String Matching: Knuth-Morris-Pratt and Boyer-Moore Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 11.04. um 11 Uhr Ausarbeitung (Download freischalten)
02.05.16	Valeria Trubnikow Thema (3): Suffix Trees: Simple Algorithm and Applications Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 18.04. um 10 Uhr Ausarbeitung (Download freischalten)
09.05.16	Niklas Probul Thema (4): Textcompression: Burrows-Wheeler-Transformation Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 25.04. um 11 Uhr Ausarbeitung (Download freischalten)
16.05.16	Pfingsten
23.05.16	Benjamin Reischer Thema (5): Suffix Arrays and BWT Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 02.05. nach dem Proseminar
30.05.16	Philipp Jahn Thema (6): Algorithmic Concepts for Sequence Alignment Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 09.05. um 11 Uhr Ausarbeitung (Download freischalten)
06.06.16	Bernhard Jonen Thema (7): Sequence Assembly Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 23.05. um 11 Uhr
13.06.16	Evelyn Scheibling Thema (8): Genome Rearrangements Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 30.05. nach dem Proseminar
20.06.16	Patrick Hoffmann Thema (9): Evolutionary Trees (Character-Based Methods) Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 06.06. nach dem Proseminar Ausarbeitung (Download freischalten)
27.06.16	Jonas Strauss Thema (10): Evolutionary Trees (Distance-Based Methods) Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 13.06. um 11 Uhr Ausarbeitung (Download freischalten)
04.07.16	Margaryta Olenchuk Thema (11): RNA Structure Prediction Betreuer: Volker Heun Vorbesprechung: 20.06. nach dem Proseminar
11.07.16	Abschlussbesprechung

Literatur

Detaillierte Themenliste mit Literaturangaben

Hinweise

Allgemeine Hinweise des Veranstaltungsleiters zu Seminaren. Es wird dringend empfohlen diese zu lesen und zu beachten.
Ian Parberry's Speaker's Guide (Hinweise zum Halten von wissenschaftlichen Vorträgen, insbesondere in der theoretischen Informatik).
Es empfielt sich die Ausarbeitung in LaTeX zu setzen, da dies eigentlich das einzige bekannte Satzsystem ist, mit dem man auch größere Texte und insbesondere mathematische Formeln bequem handhaben kann. Hierfür gibt es ein Beispiel und die dazugehörige LaTeX-Datei, die weitere Informationen enthält (Die folgende PostScript-Datei wird zur Demonstration ebenfalls benötigt).

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